Das Bw Eilsleben gehörte mit rund 150 Eisenbahnern zu den kleinsten Bahnbetriebswerken in der Reichsbahndirektion (Rbd) Magdeburg. Die Ursprünge der Dienstelle reichen zurück bis in das Jahr 1872, als die Berlin-Potsdam-Magdeburger Eisenbahn-Gesellschaft (BPME) in Eilsleben die erste Lokstation in Betrieb nahm. Ende des 19.Jahrhunderts erweiterte die Preußische Staatsbahn die Anlagen in der Nähe des Personenbahnhofs und wertete die Lokstation Eilsleben zu einer Betriebswerkstätte (Bwst) auf. Mit dem Ansteigen des Güterverkehrs auf den Strecken rund um Eilsleben genügte die Betriebswerkstätte nicht mehr den betrieblichen Belangen. Im Zusammenhang mit der Erweiterung des Bahnhofs plante die Preußische Staatsbahn daher 1908 den Bau einer neuen Betriebswerkstätte östlich des Personenbahnhofs. Mit den Bauarbeiten wurde schließlich 1914 begonnen. Sie mussten aber 1916 infolge des Ersten Weltkrieges eingestellt werden. Erst 1919 konnten die Arbeiten wieder aufgenommen werden. Die Deutsche Reichsbahn übergab dann das neue Bahnbetriebswerk (Bw) Eilsleben 1922 seiner Bestimmung.



Das Bw Eilsleben besaß lange Zeit nur regionale Bedeutung. Die hier stationierten Maschinen wickelten in erster Linie den Personen- und Nahgüterzugdienst auf den Hauptstrecken Magdeburg-Börßum und Eilsleben-Helmstedt sowie auf der Nebenbahn Eilsleben-Blumenberg-Schönebeck (Elbe) ab. Dies änderte sich erst in den 1950er-Jahren, als die Dienststelle Güterzugleistungen im Interzonendienst zwischen Helmstedt und Seddin übernahm. Erst am 1. Oktober 1974 verlor das Bw Eilsleben seine Selbstständigkeit und wurde in eine Einsatzstelle (Est) des Bw Magdeburg umgewandelt.