Een dramatische wending in de wereld van de Smurfen! Gargamel realiseert zich dat hij op het verkeerde spoor zit: door de Smurfen gevangen te nemen zal hij nooit de Steen der Wijzen kunnen maken. Na een korte maar begrijpelijke depressie besluit de tovenaar een bocht te maken. Hij wil onze blauwe vrienden helpen een nieuw gevaar het hoofd te bieden: Pepijn Paljas, een bioloog die erop gebrand is de Smurfen te bestuderen... met alle middelen die daarvoor nodig zijn. Maar kunnen ze Gargamel wel echt vertrouwen?